RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 FBXL22Q6P050 247 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 DENND1CQ8IV53 801 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 KBTBD8Q8NFY9 601 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 IGSF8Q969P0 613 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF583Q96ND8 569 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM45AQ9NWC5 275 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 EYSQ5T1H1 3165 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PPC1 479 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ACSL4O60488 711 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 UGT2B17O75795 530 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 PFKLP17858 780 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 GADD45AP24522 165 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 IGFBP5P24593 272 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 UGT2B15P54855 530 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 BNC1Q01954 994 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC190Q86UF4 302 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 EFHBQ8N7U6 833 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 EXT2Q93063 718 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 PTERQ96BW5 349 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 OR2A14Q96R47 310 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 MPP6Q9NZW5 540 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa16.36■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 MEIOCA2RUB1 952 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC14BA6NHZ5 514 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CEBPBP17676 345 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 HTR7P34969 479 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 GRIN2CQ14957 1233 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 Q6ZNB5 142 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ELMO1Q92556 727 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SIGLEC11Q96RL6 698 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CCL26Q9Y258 94 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 PKP3Q9Y446 797 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP33O14559 1287 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CKMP06732 381 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CTRB1P17538 263 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 TACR2P21452 398 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 PRKG2Q13237 762 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ALFQ53S48 1182 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CMTM8Q8IZV2 173 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 IPMKQ8NFU5 416 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 OR2T12Q8NG77 320 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SNAPC3Q92966 411 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 DZANK1Q9NVP4 752 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 TRAPPC4Q9Y296 219 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.35■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 DRGXA6NNA5 263 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CRCPO75575 148 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 C5orf22Q49AR2 442 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CCNJQ5T5M9 372 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SLC7A6Q92536 515 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 GTF2H4Q92759 462 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 FICDQ9BVA6 458 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 M0R082 166 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 CTDSP2O14595 271 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 HNF4AP41235 474 aa16.34■□□□□ 0.21
CNGA3-205ENST00000436404 GPAT3Q53EU6 434 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms