RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 GPR42O15529 346 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF4O60810 478 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SEC22BO75396 215 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CIB2O75838 187 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MYO1DO94832 1006 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 THEGLP0DJG4 465 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 F3P13726 295 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ITGAXP20702 1163 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CCR8P51685 355 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 C21orf58P58505 322 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FOXM1Q08050 763 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RCAN2Q14206 197 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DS5Q14953 304 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KIAA0040Q15053 153 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SPIN4Q56A73 249 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.45□□□□□ -0.9
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POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PARGQ86W56 976 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FAM129CQ86XR2 697 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DSELQ8IZU8 1212 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TTLQ8NG68 377 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 OR13H1Q8NG92 308 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 OR7G3Q8NG95 312 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MYOCQ99972 504 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ACPTQ9BZG2 426 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RHBGQ9H310 441 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 POT1Q9NUX5 634 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ZZEF1O43149 2961 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PR77 199 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 H0Y8X5 98 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 AIM2O14862 343 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SLC30A4O14863 429 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ANGPT2O15123 496 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CFLARO15519 480 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 IL6P05231 212 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 AMD1P17707 334 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CD22P20273 847 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TGM1P22735 817 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CD38P28907 300 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ACTR1BP42025 376 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 GSTM5P46439 218 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CPA2P48052 419 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 NUDT2P50583 147 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ARFIP1P53367 373 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DIO3P55073 304 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN8P56748 225 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ACTR1AP61163 376 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MTAPQ13126 283 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 GALNT18Q6P9A2 607 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 IYDQ6PHW0 289 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PAOXQ6QHF9 649 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 HID1Q8IV36 788 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DPP10Q8N608 796 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FAM13CQ8NE31 585 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 NETO1Q8TDF5 533 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RCN3Q96D15 328 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.44□□□□□ -0.9
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