RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358506.6

PPP1CB-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PPP1CB, Length 4,771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-202ENST00000358506 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
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PPP1CB-202ENST00000358506 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PPP1CB-202ENST00000358506 LAMP2P13473 410 aa16.08■□□□□ 0.17
PPP1CB-202ENST00000358506 AKT2P31751 481 aa16.08■□□□□ 0.17
PPP1CB-202ENST00000358506 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PPP1CB-202ENST00000358506 RGS21Q2M5E4 152 aa16.08■□□□□ 0.17
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PPP1CB-202ENST00000358506 OR4K1Q8NGD4 311 aa16.08■□□□□ 0.17
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PPP1CB-202ENST00000358506 COL4A5P29400 1685 aa16.08■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.08■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa16.08■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 OR6B1O95007 311 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 PRKACGP22612 351 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 ZZZ3Q8IYH5 903 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 GPR26Q8NDV2 337 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 HMGB4Q8WW32 186 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 COL21A1Q96P44 957 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 CLEC14AQ86T13 490 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 GON4LQ3T8J9 2241 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 RNF44Q7L0R7 432 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 KCNH6Q9H252 994 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 HOXB2P14652 356 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 HTR3DQ70Z44 454 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 OR10G2Q8NGC3 310 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 MCFD2Q8NI22 146 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 DNASE1L2Q92874 299 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 FBXL20Q96IG2 436 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 TEX26Q8N6G2 289 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 JUNP05412 331 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 ANXA8P13928 327 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 CD247P20963 164 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.165e-9■■■□□ 18.2
PPP1CB-202ENST00000358506 HTR1EP28566 365 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 FMO3P31513 532 aa16.06■□□□□ 0.16
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