RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358461.6

AFAP1-201, Transcript of actin filament associated protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene AFAP1, Length 7,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFAP1-201ENST00000358461 MNDAP41218 407 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 K7EPI3 171 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CLPTM1O96005 669 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SFTPDP35247 375 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ZNF627Q7L945 461 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ART4Q93070 314 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 H3BQF6 201 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 MATN1P21941 496 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 PNLIPRP1P54315 467 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CNPY4Q8N129 248 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CASD1Q96PB1 797 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 GMLQ99445 158 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 LRRC19Q9H756 370 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SNPHO15079 494 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 NOBOXO60393 691 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ACADLP28330 430 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 FNTBP49356 437 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 GAREM1Q9H706 876 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 FABP3P05413 133 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 IL1RNP18510 177 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 FOLR3P41439 243 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ZNF234Q14588 700 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 DUSP26Q9BV47 211 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 RHCGQ9UBD6 479 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 GJD2Q9UKL4 321 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 H3BML4 177 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 GALK2Q01415 458 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 NSMAFQ92636 917 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 Q96MT0 163 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 IFT46Q9NQC8 304 aa14.64□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 MYH11P35749 1972 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 REP15Q6BDI9 236 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 Q9N2J8 555 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 COPG2Q9UBF2 871 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 AGTR2P50052 363 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 PJA1Q8NG27 643 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 PKP4Q99569 1192 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SNED1Q8TER0 1413 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 A8MVJ9 347 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 HDAC3O15379 428 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 DRD1P21728 446 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 OR2T3Q8NH03 318 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 KCNJ9Q92806 393 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 HPF1Q9NWY4 346 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 MYH1P12882 1939 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 KCNE1P15382 129 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 MEA1Q16626 185 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 PITPNM1O00562 1244 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 TAS2R39P59534 338 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 SCARB2Q14108 478 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 NFAT5O94916 1531 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 E7EQ34 232 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 CHRNEQ04844 493 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.63□□□□□ -0.07
AFAP1-201ENST00000358461 BCL10O95999 233 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms