RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MPP5Q8N3R9 675 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP28Q8NHY6 868 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF563Q8TA94 476 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RIN3Q8TB24 985 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL29Q96CT2 875 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PWWP2AQ96N64 755 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IL17CQ9P0M4 197 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BTRCQ9Y297 605 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NKX2-8O15522 239 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GPR39O43194 453 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 S1PR4O95977 384 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK1P28482 360 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GRIA1P42261 906 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GPR3P46089 330 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 XCR1P46094 333 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK1DP48730 415 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GNA13Q14344 377 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DS3Q14952 304 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf72Q14CZ0 275 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SETDB1Q15047 1291 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TAZQ16635 292 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PYCR3Q53H96 274 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ATG16L1Q676U5 607 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ACAD11Q709F0 780 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CRLF3Q8IUI8 442 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2J2Q8N2K1 259 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ART5Q96L15 291 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BOCQ9BWV1 1114 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DPY30Q9C005 99 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR6C2Q9NZP2 312 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PKD1L2Q7Z442 2459 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 AREL1O15033 823 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV4-34P06331 123 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf89P0DMQ9 161 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 UQCRBP14927 111 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 COPAP53621 1224 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ICE2Q659A1 982 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GCNT7Q6ZNI0 430 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TTLQ8NG68 377 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SAP25Q8TEE9 199 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TCTN2Q96GX1 697 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB12Q96P63 405 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NUF2Q9BZD4 464 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CROTQ9UKG9 612 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EVPLLA8MZ36 301 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A12O75746 678 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZWINTO95229 277 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ITGA2BP08514 1039 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LIPCP11150 499 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCND1P24385 295 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PPP2R1BP30154 601 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 NME5P56597 212 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TSNQ15631 228 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PERM1Q5SV97 790 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GRTP1Q5TC63 336 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD16Q68DU8 428 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FCRLBQ6BAA4 426 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KDELC1Q6UW63 502 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.28□□□□□ -1.72
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