RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 LCTLQ6UWM7 567 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 GK5Q6ZS86 529 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf64Q86WR6 236 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT78Q8N1N4 520 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ROPN1LQ96C74 230 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4K3Q96R72 315 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CDRT15Q96T59 188 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 HBEGFQ99075 208 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR41Q9HAD4 459 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 BRF2Q9HAW0 419 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF22Q9HCT0 170 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ASIC5Q9NY37 505 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A088AWK7 358 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PP18 115 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM234BA2RU67 622 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC154A6NI56 674 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MEI4A8MW99 385 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 E7EQ34 232 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 H0Y8X5 98 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NR5A2O00482 541 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MRASO14807 208 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO1DO94832 1006 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NPPAP01160 153 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 G6PDP11413 515 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRPH2P23942 346 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 BLKP51451 505 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NEK2P51955 445 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PHEXP78562 749 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGCS1Q01581 520 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 E2F2Q14209 437 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SNCBQ16143 134 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 HID1Q8IV36 788 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NEIL2Q969S2 332 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN23Q96B33 292 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 BIRC7Q96CA5 298 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDL1Q96EA4 605 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR34Q96EX3 536 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 HHIPQ96QV1 700 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NPAS2Q99743 824 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf50Q9BV19 199 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ACPTQ9BZG2 426 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CD93Q9NPY3 652 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CROTQ9UKG9 612 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPC4 97 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR19A6NJB7 356 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF4O60810 478 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 RASGRP1O95267 797 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-34P06331 123 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PCNAP12004 261 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ACPPP15309 386 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCL12P48061 93 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB28P51157 221 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PSME3P61289 254 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 UFM1P61960 85 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms