RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 PPP6CO00743 305 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PLIN3O60664 434 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 MED26O95402 600 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PROCP04070 461 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 FGF5P12034 268 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TSPAN8P19075 237 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CD22P20273 847 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CCND1P24385 295 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CRHR1P34998 444 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ABATP80404 500 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ACY1Q03154 408 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CDC16Q13042 620 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 RNF44Q7L0R7 432 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SLC5A11Q8WWX8 675 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 OR2A5Q96R48 311 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 HAUS8Q9BT25 410 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SPRY4Q9C004 299 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 RARRES3Q9UL19 164 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1B0GTL3 188 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 G3V2L1 256 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 H0YGG7 62 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 E2F3O00716 465 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 COPEO14579 308 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 P2RX6O15547 441 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GLRA3O75311 464 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 STK17BO94768 372 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA0754O94854 1291 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 FKBP9O95302 570 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GSTA1P08263 222 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 MSL3P1P0C860 447 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 MPP2Q14168 576 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 IL11RAQ14626 422 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TEX9Q8N6V9 391 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SNX31Q8N9S9 440 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 DDA1Q9BW61 102 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 OPTCQ9UBM4 332 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SNX7Q9UNH6 387 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PLLPQ9Y342 182 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 K7EPI3 171 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 TYROBPO43914 113 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 OR2B3O76000 313 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CCNDBP1O95273 360 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 UQCRHP07919 91 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CCT5P48643 541 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CCR8P51685 355 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CDH13P55290 713 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 RAB15P59190 212 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 34.9
PDE4D-201ENST00000309641 HKDC1Q2TB90 917 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 LSMEM2Q8N112 164 aa8.7□□□□□ -1.02
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