RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA0319Q5VV43 1072 aa12□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 LCN8Q6JVE9 175 aa12□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 AKAP14Q86UN6 197 aa12□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ING5Q8WYH8 240 aa12□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 XKR8Q9H6D3 395 aa12□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 C1orf109Q9NX04 203 aa12□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CXCR6O00574 342 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF195O14628 629 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 PRLP01236 227 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 UGT2B15P54855 530 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ARPC4P59998 168 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 EMX2Q04743 252 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 VITQ6UXI7 678 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF382Q96SR6 550 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 AIG1Q9NVV5 245 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 PDE10AQ9Y233 779 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 KDELR3O43731 214 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CYB5AP00167 134 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CLUP10909 449 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 COL6A1P12109 1028 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 KIR3DL1P43629 444 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 PDGFRLQ15198 375 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 C6orf136Q5SQH8 315 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ADGRF1Q5T601 910 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CHST9Q7L1S5 443 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 LIX1Q8N485 282 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 HMGB4Q8WW32 186 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ENPP3O14638 875 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CCNKO75909 580 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 APOL3O95236 402 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 JMJD7P0C870 316 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CCL5P13501 91 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 DGKGP49619 791 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 NFKB2Q00653 900 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ECT2LQ008S8 904 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CAP1Q01518 475 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 SNX20Q7Z614 316 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 UPB1Q9UBR1 384 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 K7EPI3 171 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 SSR2P43308 183 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CBX3Q13185 183 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 MORN1Q5T089 497 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 KANK2Q63ZY3 851 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF597Q96LX8 424 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM74Q96NL1 305 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CDK15Q96Q40 435 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 FAM86C2PA6NEL3 165 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM64A6NGJ6 449 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CASKO14936 926 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 21.4
PTPRG-201ENST00000295874 KCNJ5P48544 419 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 CCR3P51677 355 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 DMWDQ09019 674 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 GPR150Q8NGU9 434 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 U3KQV3 271 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 BCKDKO14874 412 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 OAZ2O95190 189 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 NTRK1P04629 796 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 KCNA5P22460 613 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 IGFBP5P24593 272 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 HTR1EP28566 365 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRG-201ENST00000295874 GDI1P31150 447 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms