RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 MICU2Q8IYU8 434 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 C10orf111Q8N326 155 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ASAH2Q9NR71 780 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CEP290O15078 2479 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 A8MX80 341 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CCRL2O00421 344 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 AP3D1O14617 1153 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 RGS10O43665 173 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 BNIP3LO60238 219 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM20BO75063 409 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 PTTG1O95997 202 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 EPCAMP16422 314 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 PRKACBP22694 351 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SUOXP51687 545 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CAMK1Q14012 370 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CEP68Q76N32 757 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 OR4L1Q8NH43 312 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 RAD9AQ99638 391 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MED16Q9Y2X0 877 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 OBSL1O75147 1896 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 OR2A25A4D2G3 310 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SERPINA1P01009 418 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 DNTTP04053 509 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 FMO4P31512 558 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 IFNA8P32881 189 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 P2RX3P56373 397 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CYP4F3Q08477 520 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CEP78Q5JTW2 689 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 AHSA2Q719I0 299 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 NETO1Q8TDF5 533 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MMP27Q9H306 513 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SCN3BQ9NY72 215 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ARNTLO00327 626 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 BTN3A1O00481 513 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 DSCR3O14972 297 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ANKRD28O15084 1053 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 GRM6O15303 877 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 RHOBTB1O94844 696 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ITGAMP11215 1152 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 DAPP51397 102 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CLCN4P51793 760 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC7A9P82251 487 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ACVR1Q04771 509 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 IL18R1Q13478 541 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 PTGR1Q14914 329 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CARD16Q5EG05 197 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 HTR3DQ70Z44 454 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 TMEM25Q86YD3 366 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 EID2BQ96D98 161 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SNX18Q96RF0 628 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 AIREO43918 545 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MOSPD3O75425 235 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 KRT20P35900 424 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 HK3P52790 923 aa14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.1 ms