RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 ABCG5Q9H222 651 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 ACSS2Q9NR19 701 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 ARL15Q9NXU5 204 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GVC2 190 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 C9JVG2 144 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 KIR3DL1P43629 444 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 RFX3P48380 749 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 DUSP6Q16828 381 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 RABL3Q5HYI8 236 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 FAM35AQ86V20 835 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf65Q8NCR3 313 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 SLAIN1Q8ND83 568 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 DPF3Q92784 378 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 RIPOR3Q96MK2 946 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 TCF25Q9BQ70 676 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 SEMA3GQ9NS98 782 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 OXSMQ9NWU1 459 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 CKLFQ9UBR5 152 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 CALCAP01258 141 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 HNF1BP35680 557 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 MTPNP58546 118 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 KCNAB2Q13303 367 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 GRM2Q14416 872 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 RELL1Q8IUW5 271 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 C4orf32Q8N8J7 132 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM10O14672 748 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 S100GP29377 79 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 JAM2P57087 298 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 PIGFQ07326 219 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 NTRK2Q16620 822 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 IFI44LQ53G44 452 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 KCNC2Q96PR1 638 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 MMP28Q9H239 520 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 EXO5Q9H790 373 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 TVP23AA6NH52 213 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 CSN2P05814 226 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 SLC51BQ86UW2 128 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF700Q9H0M5 742 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 TUBG2Q9NRH3 451 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 IL37Q9NZH6 218 aa14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 A6NL46 340 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 SOCS2O14508 198 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 NR2F1P10589 423 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 BMP2P12643 396 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 AQP1P29972 269 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 IRF8Q02556 426 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 ABRQ12979 859 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 LCP2Q13094 533 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 RBFAQ8N0V3 343 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 C10orf90Q96M02 699 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 FN3KQ9H479 309 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 MARK1Q9P0L2 795 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 HRH3Q9Y5N1 445 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 SYN3O14994 580 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 LYRM1O43325 122 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 S100A8P05109 93 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 HDCP19113 662 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 NUDT6P53370 316 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 INHBCP55103 352 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 LSMEM1Q8N8F7 131 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 ELMOD3Q96FG2 381 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 BTN2A3PQ96KV6 586 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 GPR20Q99678 358 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 NIPAL2Q9H841 368 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 MKS1Q9NXB0 559 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM12O43184 909 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 TGFB1I1O43294 461 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 NDNFQ8TB73 568 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM80Q96HE8 168 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 TGIF2Q9GZN2 237 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRO-201ENST00000281171 PIP5K1BO14986 540 aa13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms