RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NME2P1O60361 137 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 AP2A1O95782 977 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 COMTP21964 271 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NME2P22392 152 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC1A1P43005 524 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 KEAP1Q14145 624 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A25Q6KCM7 469 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 AMER3Q8N944 861 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ULK4Q96C45 1275 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC42Q96M95 316 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 RNF212BA8MTL3 300 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NFKB1P19838 968 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DL3P43628 341 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 HADHBP55084 474 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R2BQ00005 443 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MEP1AQ16819 746 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MUM1Q2TAK8 710 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 BTBD16Q32M84 506 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SHEQ5VZ18 495 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ACAD11Q709F0 780 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SPC24Q8NBT2 197 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 HEXDCQ8WVB3 486 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FICDQ9BVA6 458 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 INTUQ9ULD6 942 aa15.49■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GABRR3A8MPY1 467 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PSTPIP1O43586 416 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NRP2O60462 931 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CST8O60676 142 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A12O75746 678 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SUN1O94901 812 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GSTM1P09488 218 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TNNT1P13805 278 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MARCKSL1P49006 195 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NR2C2P49116 596 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GSTM4Q03013 218 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CBLCQ9ULV8 474 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FAM169AQ9Y6X4 670 aa15.48■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 USP27XA6NNY8 438 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ESPNB1AK53 854 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 H7C1Q1 480 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SPOPO43791 374 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 S1PR4O95977 384 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TFEBP19484 476 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC26A3P40879 764 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF7P61962 342 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PRTGQ2VWP7 1150 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 KAZNQ674X7 775 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF567Q8N184 647 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A18Q96BI1 424 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa15.47■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TARM1B6A8C7 271 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 KDM1AO60341 852 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TPM1P09493 284 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ITGALP20701 1170 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TFDP2Q14188 446 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 RNF44Q7L0R7 432 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SNX20Q7Z614 316 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LIX1LQ8IVB5 337 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms