RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.1■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 ERVK-18Q9QC07 812 aa20.1■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.1■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 MTX2O75431 263 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 SLCO2B1O94956 709 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 FKBP9O95302 570 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 OCM2P0CE71 109 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 FMO3P31513 532 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 MLLT10P55197 1068 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 VEZF1Q14119 521 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 LAPTM4AQ15012 233 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 PARP8Q8N3A8 854 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CPA6Q8N4T0 437 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 NAT16Q8N8M0 369 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CHPT1Q8WUD6 406 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 ZNF347Q96SE7 839 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 KRT87PA6NCN2 255 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 C1QCP02747 245 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CYP4B1P13584 511 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 LAG3P18627 525 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CD22P20273 847 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 NR4A1P22736 598 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 SLC35A2P78381 396 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 VLDLRP98155 873 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CHST14Q8NCH0 376 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 ATL1Q8WXF7 558 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 SOBPA7XYQ1 873 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 GABARAPO95166 117 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 LRG1P02750 347 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 GSTM1P09488 218 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 HSD3B1P14060 373 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 HSD3B2P26439 372 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 DOC2AQ14183 400 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 CREBZFQ9NS37 354 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.08■□□□□ 0.81
STRADB-201ENST00000194530 A0A1W2PRU2 124 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 SLC22A1O15245 554 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 SGTAO43765 313 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 SULT1C4O75897 302 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 DIRAS1O95057 198 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 ACVR2AP27037 513 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 HNF4AP41235 474 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 ZNF846Q147U1 533 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 Q6ZVU0 165 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 SCAMP4Q969E2 229 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 TIFAQ96CG3 184 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 DUSP26Q9BV47 211 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 REEP1Q9H902 201 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 COL4A6Q14031 1691 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 H0YIV9 168 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 DPM1O60762 260 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 LAMP1P11279 417 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 GJA1P17302 382 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 VIPR1P32241 457 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 ASMTP46597 345 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 RGS21Q2M5E4 152 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 VPS37AQ8NEZ2 397 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 CDC26Q8NHZ8 85 aa20.07■□□□□ 0.8
STRADB-201ENST00000194530 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms