RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 BTN2A3PQ96KV6 586 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PQ67 120 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C9J4A7 227 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ERP29P30040 261 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 RTP1P59025 263 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CHRFAM7AQ494W8 412 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM220Q6QAJ8 160 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GIMAP5Q96F15 307 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 HTR1AP08908 422 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP4CP60510 307 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SSX2Q16385 188 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5K1Q8NHB7 308 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ASB15Q8WXK1 588 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SULT4A1Q9BR01 284 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM234BA2RU67 622 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 M0QX08 132 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 BRINP1O60477 761 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 BMP8BP34820 402 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF460Q14592 562 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ICKQ9UPZ9 632 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PREX2Q70Z35 1606 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MARCKSL1P49006 195 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CRISP3P54108 245 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR157Q5UAW9 335 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 STON2Q8WXE9 905 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C19orf12Q9NSK7 152 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PPL8 197 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 JUNP05412 331 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 DDR1Q08345 913 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PON3Q15166 354 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 NCEH1Q6PIU2 408 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ARL14Q8N4G2 192 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 EDF1O60869 148 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNA1P01562 189 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 LGALS2P05162 132 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GNAZP19086 355 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PIK3CBP42338 1070 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 UNC93B1Q9H1C4 597 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PIP5K1BO14986 540 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PNLIPRP1P54315 467 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MFSD13AQ14CX5 517 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ABRAXAS2Q15018 415 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 OR10G2Q8NGC3 310 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CMKLR1Q99788 373 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 OTOFQ9HC10 1997 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GTF2F2P13984 249 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GNSP15586 552 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TRABD2AQ86V40 505 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ACBD4Q8NC06 268 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PLA2G15Q8NCC3 412 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf196B1AJZ1 125 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GLUD1P00367 558 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 HTR2AP28223 471 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM119Q4V9L6 283 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC44A1Q8WWI5 657 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 DEC1Q9P2X7 70 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ERVK-19Q9WJR5 959 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1B0GVM2 712 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PRORSD1PA6NEY8 169 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC18A2Q05940 514 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PAOXQ6QHF9 649 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MON1AQ86VX9 555 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 OR56B2PQ8NGI1 322 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CAMK1GQ96NX5 476 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF616Q08AN1 781 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 AQP11Q8NBQ7 271 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CD180Q99467 661 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GLOD4Q9HC38 313 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 AMBNQ9NP70 447 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms