RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 YIPF2Q9BWQ6 316 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 GPAMQ9HCL2 828 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 STMN3Q9NZ72 180 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 MEMO1Q9Y316 297 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 SYCE3A1L190 88 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 FFAR3O14843 346 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 GPR42O15529 346 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 MFAP3LO75121 409 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 MLYCDO95822 493 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 TPM1P09493 284 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 AOAHP28039 575 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 SLC26A3P40879 764 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 TLE4Q04727 773 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 NAA25Q14CX7 972 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 TMED2Q15363 201 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC38Q502W7 563 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 KRTCAP3Q53RY4 240 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 AMER3Q8N944 861 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 HDAC10Q969S8 669 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 GPR137Q96N19 417 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 A0A1W2PPV9 198 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 RCCD1A6NED2 376 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 IQCF5A8MTL0 148 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 H0YGG7 62 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 PSMD3O43242 534 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 C1orf105O95561 183 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 P3H1Q32P28 736 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 AMER2Q8N7J2 671 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 OR4L1Q8NH43 312 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 MRFAP1Q9Y605 127 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-230ENST00000600058 FAM227AF5H4B4 570 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 TTI1O43156 1089 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 PHF2O75151 1096 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 TJP3O95049 919 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 MAGEA1P43355 309 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 BDKRB1P46663 353 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 SEMA3AQ14563 771 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF534Q76KX8 674 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 LINC00523Q86TU6 105 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 KRT222Q8N1A0 295 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 DPH7Q9BTV6 452 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 NFS1Q9Y697 457 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 KRT87PA6NCN2 255 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 CBFA2T2O43439 604 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 VPS26AO75436 327 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ANXA5P08758 320 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 C8orf89P0DMQ9 161 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 CD1EP15812 388 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 CMPK1P30085 196 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 CCNFP41002 786 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 EFNA3P52797 238 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 CSNK1G2P78368 415 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ACVR1Q04771 509 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 HKDC1Q2TB90 917 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 TSTD2Q5T7W7 516 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 VSTM4Q8IW00 320 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 MDS2Q8NDY4 140 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 OR52K1Q8NGK4 314 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF354BQ96LW1 612 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 SPATA7Q9P0W8 599 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ACANP16112 2415 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 ASPDHA6ND91 283 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 A8MUI8 341 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 FANCGO15287 622 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-230ENST00000600058 FOXS1O43638 330 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms