RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 APOOQ9BUR5 198 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX101Q9BY14 249 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2AG1Q9H205 316 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 VPS11Q9H270 941 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SYTL2Q9HCH5 934 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 PDE7BQ9NP56 450 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SNX15Q9NRS6 342 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 PDP2Q9P2J9 529 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 PADI1Q9ULC6 663 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 OR1A2Q9Y585 309 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CACNA1CQ13936 2221 aa11.18□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A087X1B8 175 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2AG2A6NM03 316 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 JRKO75564 520 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 SRP54P61011 504 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 RAPSNQ13702 412 aa11.17□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 KCTD16Q68DU8 428 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM220Q6QAJ8 160 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ENPP7Q6UWV6 458 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TIFABQ6ZNK6 161 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZS92 163 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.17□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM74Q86UV6 250 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TRABD2AQ86V40 505 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CYP4X1Q8N118 509 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CT55Q8WUE5 264 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 COX14Q96I36 57 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 P2RY12Q9H244 342 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 RMI1Q9H9A7 625 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 GPAMQ9HCL2 828 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 EURLQ9NYK6 297 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A096LPK6 155 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MU76 341 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 COPEO14579 308 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 NIPSNAP2O75323 286 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 ALPPP05187 535 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 PYGBP11216 843 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 VCLP18206 1134 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 KRT4P19013 534 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 FDXRP22570 491 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 CCT5P48643 541 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 PRLHRP49683 370 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SMSP52788 366 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TAS2R39P59534 338 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 GSTM4Q03013 218 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 BIRC2Q13490 618 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 IL10RAQ13651 578 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 NFATC4Q14934 902 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 PCOLCEQ15113 449 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CTSL3PQ5NE16 218 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 KLC3Q6P597 504 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 PELI3Q8N2H9 469 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CLDN19Q8N6F1 224 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 TM9SF4Q92544 642 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM136AQ96C01 138 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF31Q96EP0 1072 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR92Q96MX6 357 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 BIRC8Q96P09 236 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR21Q99679 349 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 MCMBPQ9BTE3 642 aa11.16□□□□□ -0.62
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