RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	GFY	I3L273	518 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516		M0QX08	132 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRAMEF12	O95522	483 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SERPINA1	P01009	418 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	LRG1	P02750	347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CKM	P06732	381 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCT	P40126	519 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	RANBP1	P43487	201 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCDC1	P59894	354 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	MTAP	Q13126	283 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	VEZF1	Q14119	521 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CPZ	Q66K79	652 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR26	Q8NDV2	337 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	S100Z	Q8WXG8	99 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	WBP2	Q969T9	261 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	NODAL	Q96S42	347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRR23A	A6NEV1	266 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516		K7ERQ8	282 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF197	O14709	1029 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	BCKDK	O14874	412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	ATE1	O95260	518 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLIC3	O95833	236 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	MT-ND1	P03886	318 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCNA	P12004	261 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SRC	P12931	536 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	AMD1	P17707	334 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	FPR1	P21462	350 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGFBP5	P24593	272 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	GDF5	P43026	501 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPINT3	P49223	89 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	GZMM	P51124	257 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	HYAL1	Q12794	435 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q6ZNX1	250 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	HHIP	Q96QV1	700 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	HBEGF	Q99075	208 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	PREB	Q9HCU5	417 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRIO	O75962	3097 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	WASH3P	C4AMC7	463 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-223	ENST00000588516	FPGT	O14772	594 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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