RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNF470Q6ECI4 717 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNF425Q6IV72 752 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CASC4Q6P4E1 433 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PAQR7Q86WK9 346 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 REXO1L1PQ8IX06 675 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 GIMAP7Q8NHV1 300 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 COG1Q8WTW3 980 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MVB12AQ96EY5 273 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SERPINB12Q96P63 405 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 AGAP4Q96P64 663 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PKP4Q99569 1192 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SLC30A3Q99726 388 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CRB3Q9BUF7 120 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 LHPPQ9H008 270 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SYNPO2LQ9H987 977 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CSAG2Q9Y5P2 127 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 WIPF3A6NGB9 483 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNF839A8K0R7 811 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZGLP1P0C6A0 271 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MPC1LP0DKB6 136 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 RELAQ04206 551 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 OCA2Q04671 838 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 Q0VFX4 171 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ICE2Q659A1 982 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 DENND6AQ8IWF6 608 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PARP9Q8IXQ6 854 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 LMNTD2Q8IXW0 634 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PRR7Q8TB68 274 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNF480Q8WV37 535 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 KCNJ9Q92806 393 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MIEF2Q96C03 454 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PBKQ96KB5 322 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 TAC3Q9UHF0 121 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CDC14AQ9UNH5 594 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 NTNG1Q9Y2I2 539 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 A0A1W2PQ72 361 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CTAGE9A4FU28 777 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 E7ENX8 843 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.381e-8■■■■■ 29.8
CTIF-206ENST00000588345 CCNDBP1O95273 360 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SLC16A8O95907 504 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 HPP00738 406 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ERVK-10P10266 1014 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 FBLP22087 321 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 COILP38432 576 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 TSFMP43897 325 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ABATP80404 500 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 TAP2Q03519 686 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 DSG2Q14126 1118 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 HIF1AQ16665 826 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 C4orf17Q53FE4 359 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 GARNL3Q5VVW2 1013 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ATG9BQ674R7 924 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZNF549Q6P9A3 640 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CYHR1Q6ZMK1 362 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ASB11Q8WXH4 323 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CABS1Q96KC9 395 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 OR2A5Q96R48 311 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 C3orf18Q9UK00 162 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 DHRS7Q9Y394 339 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 JRKLQ9Y4A0 524 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 COMMD10Q9Y6G5 202 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 POLEQ07864 2286 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 GFYI3L273 518 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MAP2K7O14733 419 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 KIF5CO60282 957 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ACPPP15309 386 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 EZRP15311 586 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SLC1A2P43004 574 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 GLRBP48167 497 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CTBP1Q13363 440 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 VWA2Q5GFL6 755 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CSNK1A1LQ8N752 337 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MS4A14Q96JA4 679 aa17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms