RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TK2	O00142	265 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CDH16	O75309	829 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	STK17B	O94768	372 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TUBB	P07437	444 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	LIPC	P11150	499 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	COL6A2	P12110	1019 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CDH1	P12830	882 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	NPPB	P16860	134 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	RORA	P35398	523 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	HNMT	P50135	292 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	MAP7	Q14244	749 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ACAP2	Q15057	778 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	EGFL8	Q99944	293 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TBK1	Q9UHD2	729 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TLK1	Q9UKI8	766 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ACACA	Q13085	2346 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538		A0A087WV48	116 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PPM1	405 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	FITM1	A5D6W6	292 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	STMND1	H3BQB6	276 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	P2RX6	O15547	441 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	RAD1	O60671	282 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SUPT3H	O75486	399 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	KIAA0754	O94854	1291 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	MED26	O95402	600 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ITGAX	P20702	1163 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	GDF5	P43026	501 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	HSPA7	P48741	367 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	AGTR2	P50052	363 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ITGA1	P56199	1179 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	REEP5	Q00765	189 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	RELA	Q04206	551 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ZNF844	Q08AG5	666 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	GPS2	Q13227	327 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	E2F2	Q14209	437 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TGIF1	Q15583	401 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ESAM	Q96AP7	390 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CABS1	Q96KC9	395 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	CCDC77	Q9BR77	488 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	HAUS8	Q9BT25	410 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SARG	Q9BW04	601 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP22-211	ENST00000584538	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.36	□□□□□ -0.59

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