RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PMEPA1Q969W9 287 aa23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CTRCQ99895 268 aa23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RARRES3Q9UL19 164 aa23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMCO1Q9UM00 188 aa23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SNX7Q9UNH6 387 aa23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DYRK1BQ9Y463 629 aa23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.04■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C9orf172C9J069 976 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGF5P12034 268 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KRT4P19013 534 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GDF5P43026 501 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC18A2Q05940 514 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP4F3Q08477 520 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DEFB110Q30KQ9 67 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FBXO48Q5FWF7 155 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPP1R3BQ86XI6 285 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR8K5Q8NH50 307 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZPBPQ9BS86 351 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 THSD1Q9NS62 852 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM184CQ9NVA4 438 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa23.03■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM150CB9EJG8 249 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COPEO14579 308 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMIM24O75264 130 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SBK3P0C264 359 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CDH1P12830 882 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ERVPABLB-1P60509 514 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CASP8Q14790 479 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SETDB1Q15047 1291 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PFKFB4Q16877 469 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C16orf46Q6P387 395 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF44Q7L0R7 432 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADCK2Q7Z695 626 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM151AQ8N4L1 468 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC5A11Q8WWX8 675 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ESAMQ96AP7 390 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CD244Q9BZW8 370 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNAJC11Q9NVH1 559 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FOXJ2Q9P0K8 574 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLCL2Q9UPR0 1127 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNE2Q9Y6J6 123 aa23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 H7BY64 318 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HCRTR1O43613 425 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NRP2O60462 931 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CTSVO60911 334 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC5A2P31639 672 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CRHR1P34998 444 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCT5P48643 541 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AGTR2P50052 363 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CDC16Q13042 620 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBC1D25Q3MII6 688 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MDM1Q8TC05 714 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NEIL2Q969S2 332 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRAP1Q96NZ9 151 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MKS1Q9NXB0 559 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DKK4Q9UBT3 224 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PILRAQ9UKJ1 303 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ASB1Q9Y576 335 aa23.01■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EZRP15311 586 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CSNK1G2P78368 415 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RELAQ04206 551 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABHD11Q8NFV4 315 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR1L3Q8NH93 324 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APOPT1Q96IL0 206 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PELI2Q9HAT8 420 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OPTCQ9UBM4 332 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EMCNQ9ULC0 261 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRID1Q9ULK0 1009 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPTBP11277 2137 aa23■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SDK2Q58EX2 2172 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A0J9YVX5 310 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HAT1O14929 419 aa22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms