RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FAM187A	A6NFU0	413 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MROH6	A6NGR9	719 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR1I1	O60431	355 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PIAS1	O75925	651 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KRT38	O76015	456 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KLHL18	O94889	574 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	VAPB	O95292	243 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	S1PR4	O95977	384 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RPN2	P04844	631 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR56A5	P0C7T3	313 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ICAM2	P13598	275 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ACPP	P15309	386 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MAG	P20916	626 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HTR1E	P28566	365 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SSTR2	P30874	369 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ELK3	P41970	407 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MAGEA6	P43360	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TNFSF10	P50591	281 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RAB28	P51157	221 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TDGF1P3	P51864	188 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PLTP	P55058	493 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PRAME	P78395	509 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OCA2	Q04671	838 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CACNG1	Q06432	222 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ITIH4	Q14624	930 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	BRD3	Q15059	726 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DBN1	Q16643	649 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PCID2	Q5JVF3	399 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	C4orf22	Q6V702	233 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PACS1	Q6VY07	963 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TRIM73	Q86UV7	250 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	STYX	Q8WUJ0	223 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	IFT81	Q8WYA0	676 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SLCO2A1	Q92959	643 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TTC1	Q99614	292 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NRTN	Q99748	197 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ERP44	Q9BS26	406 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ABI3	Q9P2A4	366 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SOX13	Q9UN79	622 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PCSK5	Q92824	1860 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQ72	361 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FITM1	A5D6W6	292 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	IQCF5	A8MTL0	148 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TARM1	B6A8C7	271 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CCL21	O00585	134 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MAP2K7	O14733	419 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TP73	O15350	636 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RASAL1	O95294	804 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MLYCD	O95822	493 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SERPINA7	P05543	415 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TPBGL	P0DKB5	382 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ERVK-10	P10266	1014 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CD9	P21926	228 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CXCR2	P25025	360 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ARNT	P27540	789 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FOXN2	P32314	431 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CA7	P43166	264 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NPY2R	P49146	381 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SMS	P52788	366 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KCNK10	P57789	538 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FOXL2	P58012	376 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MPP1	Q00013	466 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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