RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 CTSBP07858 339 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 YBX1P67809 324 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 DCDP81605 110 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 NCF4Q15080 339 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 PRTGQ2VWP7 1150 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 LCTLQ6UWM7 567 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 CEP97Q8IW35 865 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 EXTL1Q92935 676 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 NACC2Q96BF6 587 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 OR2A5Q96R48 311 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 SARGQ9BW04 601 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 ACAT2Q9BWD1 397 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 DERL2Q9GZP9 239 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 TXNDC16Q9P2K2 825 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 TCFL5Q9UL49 500 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 POLHQ9Y253 713 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 CFAP46Q8IYW2 2715 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 A0A1B0GX78 115 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 DSCR3O14972 297 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 ALBP02768 609 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 TBPL1P62380 186 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 CDKL4Q5MAI5 379 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 FKBP10Q96AY3 582 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 THAP11Q96EK4 314 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-203ENST00000547701 BSNQ9UPA5 3926 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 MED13Q9UHV7 2174 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 C9J4A7 227 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 TXNDC9O14530 226 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 KATNA1O75449 491 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ECHS1P30084 290 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CCR10P46092 362 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 GARNL3Q5VVW2 1013 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC25Q86WR0 208 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 EXD3Q8N9H8 876 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 FBF1Q8TES7 1133 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 MVB12AQ96EY5 273 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 HAUS8Q9BT25 410 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 GPAMQ9HCL2 828 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 FURINP09958 794 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 NPPBP16860 134 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC26A3P40879 764 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 HNMTP50135 292 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CSRP3P50461 194 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PGGT1BP53609 377 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ANKRD49Q8WVL7 239 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 RUFY1Q96T51 708 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CUTCQ9NTM9 273 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ARL15Q9NXU5 204 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 OARD1Q9Y530 152 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 A0A0J9YVX5 310 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC189A1A4V9 331 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PIAS1O75925 651 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 STMN1P16949 149 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC12A2P55011 1212 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 NAE1Q13564 534 aa22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms