RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546697.1

SSH1-204, Transcript of slingshot protein phosphatase 1, humanhuman

TSL 3

Gene SSH1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH1-204ENST00000546697 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.66□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 SNX7Q9UNH6 387 aa14.66□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.66□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 PCSK5Q92824 1860 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 CDC14CA4D256 554 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 FAM159BA6NKW6 160 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 NRP2O60462 931 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 NFKB2Q00653 900 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 GUCY2DQ02846 1103 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 C2orf54Q08AI8 447 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 PHKG1Q16816 387 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 SBSNQ6UWP8 590 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 MED25Q71SY5 747 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 COX15Q7KZN9 410 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 ZNF605Q86T29 641 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 OR56A3Q8NH54 315 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 CFAP36Q96G28 342 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 TAC3Q9UHF0 121 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SSH1-204ENST00000546697 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 A0A1W2PQ72 361 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 UMODP07911 640 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TBPL1P62380 186 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 CDKL1Q00532 357 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 LCTLQ6UWM7 567 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 THAP11Q96EK4 314 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 LINGO1Q96FE5 620 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 C10orf90Q96M02 699 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 SPSB2Q99619 263 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 HYKKA2RU49 373 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 H0YGG7 62 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TXNDC9O14530 226 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 MED26O95402 600 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 IGHEP01854 428 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 GPX6P59796 221 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 NFATC3Q12968 1075 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 FAM53BQ14153 422 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 NKG7Q16617 165 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 MUM1Q2TAK8 710 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 MRGPREQ86SM8 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 RAB43Q86YS6 212 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 HPS6Q86YV9 775 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 RELL1Q8IUW5 271 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 PTERQ96BW5 349 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 FBXL8Q96CD0 374 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 DPH5Q9H2P9 285 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 TLK1Q9UKI8 766 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 MED13Q9UHV7 2174 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH1-204ENST00000546697 A0A0J9YVX5 310 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms