RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546076.5

TSPAN11-204, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TSPAN11, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-204ENST00000546076 ALPPP05187 535 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 MPC1LP0DKB6 136 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 AGXTP21549 392 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 GABRB3P28472 473 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 HSD17B2P37059 387 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 SSPNQ14714 243 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 DCAF10Q5QP82 559 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 MLIPQ5VWP3 458 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CUZD1Q86UP6 607 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ASB11Q8WXH4 323 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 GPR21Q99679 349 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 DPH5Q9H2P9 285 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 GFYI3L273 518 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 LRRTM2O43300 516 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CATP04040 527 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 PVRP15151 417 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 MGAT5Q09328 741 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CYP2A13Q16696 494 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 Q6ZS92 163 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CYS1Q717R9 158 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CD200R1Q8TD46 325 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 IP6K3Q96PC2 410 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 SLC30A3Q99726 388 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 SEC16AO15027 2179 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 MYO1CO00159 1063 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 PEX12O00623 359 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 ZBTB14O43829 449 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 HBQ1P09105 142 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 PLTPP55058 493 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 FOXL2P58012 376 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 C1orf189Q5VU69 101 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 PALM2Q8IXS6 379 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 MNS1Q8NEH6 495 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 TM9SF4Q92544 642 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 IL17FQ96PD4 163 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 ZFATQ9P243 1243 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 VWA7Q9Y334 891 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 POLEQ07864 2286 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 ZNF839A8K0R7 811 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 TARM1B6A8C7 271 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 GSTA2P09210 222 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 ERGP11308 486 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 FOLR3P41439 243 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 BDKRB1P46663 353 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 RGS4P49798 205 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 CUL1Q13616 776 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN11-204ENST00000546076 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms