RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525081.1

NSD3-204, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, human

TSL 2

Gene NSD3, Length 1,581 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD3-204	ENST00000525081	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	TRIM58	Q8NG06	486 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SMPDL3A	Q92484	453 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	MIEF2	Q96C03	454 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	LHPP	Q9H008	270 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SVIL	O95425	2214 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081		E5RI56	91 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PFDN6	O15212	129 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CLDN1	O95832	211 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SLC16A8	O95907	504 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	LDLR	P01130	860 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	COL8A1	P27658	744 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	MAGEA6	P43360	314 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	OCA2	Q04671	838 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CTBP1	Q13363	440 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CUL1	Q13616	776 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	MUM1	Q2TAK8	710 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	HKDC1	Q2TB90	917 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CABS1	Q96KC9	395 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CNDP1	Q96KN2	507 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PKP4	Q99569	1192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	TAC3	Q9UHF0	121 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	C3orf18	Q9UK00	162 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	MED16	Q9Y2X0	877 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CREBBP	Q92793	2442 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	WIPF3	A6NGB9	483 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	USP1	O94782	785 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	KLHL18	O94889	574 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	DDAH2	O95865	285 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	KRT14	P02533	472 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ACPP	P15309	386 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PAM	P19021	973 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PNLIPRP1	P54315	467 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CCZ1B	P86790	482 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ICE2	Q659A1	982 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ATG9B	Q674R7	924 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	PAQR7	Q86WK9	346 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF480	Q8WV37	535 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	MS4A14	Q96JA4	679 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	OR2A5	Q96R48	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CTAGE9	A4FU28	777 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	IDS	B3KWA1	339 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081		E7ENX8	843 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	MAP2K7	O14733	419 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	KIF5C	O60282	957 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	VPS26A	O75436	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	HP	P00738	406 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	SLC1A2	P43004	574 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	TAP2	Q03519	686 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	CDC16	Q13042	620 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	DSG2	Q14126	1118 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms