RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF347	Q96SE7	839 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193		K7ERQ8	282 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	STATH	P02808	62 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FYN	P06241	537 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PCSK2	P16519	638 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CD247	P20963	164 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FDXR	P22570	491 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR1E2	P47887	323 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CLCN4	P51793	760 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SKP1	P63208	163 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	NFATC2	Q13469	925 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DNASE1L3	Q13609	305 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SEMA3A	Q14563	771 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf22	Q49AR2	442 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SCD5	Q86SK9	330 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FCGR1B	Q92637	280 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MCUB	Q9NWR8	336 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	EBF1	Q9UH73	591 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	GABRQ	Q9UN88	632 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PDPK1	O15530	556 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CAPN15	O75808	1086 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HTR1E	P28566	365 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RCVRN	P35243	200 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CDKL1	Q00532	357 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RING1	Q06587	406 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC157	Q569K6	752 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GALNT10	Q86SR1	603 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	AMZ2	Q86W34	360 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	COMMD2	Q86X83	199 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DNASE1L2	Q92874	299 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MPZL2	O60487	215 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SOX14	O95416	240 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NPPA	P01160	153 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GALT	P07902	379 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PTPN2	P17706	415 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NT5E	P21589	574 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PNLIPRP1	P54315	467 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FAM189B	P81408	668 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM74	Q86UV6	250 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NFKBID	Q8NI38	313 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PEX13	Q92968	403 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FABP12	A6NFH5	140 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RASAL1	O95294	804 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HIST1H2AB	P04908	130 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R50	P59544	299 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DSTN	P60981	165 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM17	P78536	824 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RAPSN	Q13702	412 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		7.83	□□□□□ -1.16

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