RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 C9P02748 559 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CBSLP0DN79 551 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CBSP35520 551 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SSR2P43308 183 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MAPK12P53778 367 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CSNK2BP67870 215 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 FAM189BP81408 668 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TRIM48Q8IWZ4 208 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PPP1R16AQ96I34 528 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 IL4I1Q96RQ9 567 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 KCNS3Q9BQ31 491 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 RIMKLBQ9ULI2 386 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 A0A096LPI6 279 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 IDH3BO43837 385 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TPST2O60704 377 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 UGT2B17O75795 530 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 HPRP00739 348 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 LAG3P18627 525 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SGCGQ13326 291 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SCARB2Q14108 478 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 DCST1Q5T197 706 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 AGTRAPQ6RW13 159 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 Q6ZVL8 140 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 OR4K1Q8NGD4 311 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 FCGR1BQ92637 280 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC35A5Q9BS91 424 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 KLHL1Q9NR64 748 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC1A7O00341 560 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 AP1G1O43747 822 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ATE1O95260 518 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ACRV1P26436 265 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TGM3Q08188 693 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 NCEH1Q6PIU2 408 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TADA1Q96BN2 335 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 FAIM2Q9BWQ8 316 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CD300AQ9UGN4 299 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 GMEB1Q9Y692 573 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MCM3APO60318 1980 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 FOCADQ5VW36 1801 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC35G4P0C7Q5 338 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 NOS3P29474 1203 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 KDELR2P33947 212 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 BDKRB1P46663 353 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PREPP48147 710 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ITGA1P56199 1179 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MVKQ03426 396 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 IL18R1Q13478 541 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 VMACQ2NL98 169 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PYDC2Q56P42 97 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 GDPD4Q6W3E5 623 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CTPS2Q9NRF8 586 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 A0A1W2PRB8 838 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SERPINI2O75830 405 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PTPN5P54829 565 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 NHSL2Q5HYW2 709 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 HMBOX1Q6NT76 420 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 GALNT7Q86SF2 657 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TSPAN33Q86UF1 283 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 OR2AG1Q9H205 316 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PIPSLA2A3N6 862 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 MT-ND2P03891 347 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 HOXC13P31276 330 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 OR1E2P47887 323 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TAB1Q15750 504 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ARSIQ5FYB1 569 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 PLPP4Q5VZY2 271 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 VTCN1Q7Z7D3 282 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SLC15A4Q8N697 577 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF347Q96SE7 839 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 AIF1LQ9BQI0 150 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CNPPD1Q9BV87 410 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 ITPAQ9BY32 194 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.355e-6■□□□□ 10.2
SPCS3-201ENST00000503362 TBCCD1Q9NVR7 557 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 BPIP17213 487 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 AGXTP21549 392 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 DCTP40126 519 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 SELPLGQ14242 412 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 TYSND1Q2T9J0 566 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS3-201ENST00000503362 CYP27C1Q4G0S4 372 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms