RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FCRL5	Q96RD9	977 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TAAR6	Q96RI8	345 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MIPEP	Q99797	713 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CUTC	Q9NTM9	273 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	POLG2	Q9UHN1	485 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HIVEP1	P15822	2718 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf60	A6NFR6	353 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	DSCR3	O14972	297 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HP	P00738	406 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	AGT	P01019	485 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MYBL2	P10244	700 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MAG	P20916	626 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NSG1	P42857	185 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	GEM	P55040	296 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OCA2	Q04671	838 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	WASHC5	Q12768	1159 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MPP2	Q14168	576 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TFDP2	Q14188	446 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	GRM7	Q14831	915 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX20	Q7Z614	316 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF567	Q8N184	647 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	P3H4	Q92791	437 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGED4	Q96JG8	741 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	VAT1	Q99536	393 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	APOL2	Q9BQE5	337 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSF	Q9UBX1	484 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZD2	O15018	2839 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CST8	O60676	142 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA9	O76027	345 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCR2	P25025	360 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MC4R	P32245	332 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1D4	P47884	311 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF10	P50591	281 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB28	P51157	221 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	XIAP	P98170	497 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TLE4	Q04727	773 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511		Q0VFX4	171 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DS3	Q14952	304 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FIGN	Q5HY92	759 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CNST	Q6PJW8	725 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ELMO1	Q92556	727 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MIEF2	Q96C03	454 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf44	Q96CB5	159 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HAUS1	Q96CS2	278 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf18	Q9UK00	162 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP9	Q99996	3911 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL22	O00626	93 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC19A2	O60779	497 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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