RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494465.5

ATG4B-225, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 2,365 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-225ENST00000494465 LCN8Q6JVE9 175 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 MED27Q6P2C8 311 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 FAM124AQ86V42 546 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 MSRB3Q8IXL7 192 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 LAS2Q8IYD9 372 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 TESCQ96BS2 214 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 PKP2Q99959 881 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 ECSITQ9BQ95 431 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 EBPLQ9BY08 206 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 SPNS1Q9H2V7 528 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-225ENST00000494465 LATO43561 262 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PI15O43692 258 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 DFNA5O60443 496 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 KCNH1O95259 989 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 NDUFV2P19404 249 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 GRIA3P42263 894 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 CCINQ13939 588 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 ASB12Q8WXK4 309 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 OR52E6Q96RD3 313 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 MYOCQ99972 504 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SERHLQ9NQF3 203 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 ARPC2O15144 300 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 MBTPS2O43462 519 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 CAPNS1P04632 268 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PCNAP12004 261 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 MTPNP58546 118 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PYCR3Q53H96 274 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 NXPE4Q6UWF7 544 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 IFNEQ86WN2 208 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 FAM9CQ8IZT9 166 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 EFCAB11Q9BUY7 163 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 RMI1Q9H9A7 625 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 AP4S1Q9Y587 144 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PIPSLA2A3N6 862 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PCSK2P16519 638 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SLC7A1P30825 629 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 CYP2A13Q16696 494 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SFT2D3Q587I9 215 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 LCTLQ6UWM7 567 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PDSS2Q86YH6 399 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 CHTF18Q8WVB6 975 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SLC6A13Q9NSD5 602 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 SUFUQ9UMX1 484 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 KCNK6Q9Y257 313 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 TRIOO75962 3097 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 POM121BA6NF01 834 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 AQP12BA6NM10 295 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PEX1O43933 1283 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 LRATO95237 230 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 B3GALT4O96024 378 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 RPN2P04844 631 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 HTR1EP28566 365 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 ACSL1P33121 698 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 LRIT3Q3SXY7 679 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 FAM110BQ8TC76 370 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 LRGUKQ96M69 825 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 IKZF5Q9H5V7 419 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF839A8K0R7 811 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms