RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	ARID1A	O14497	2285 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	VPS13C	Q709C8	3753 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FITM1	A5D6W6	292 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ISM1	B1AKI9	464 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TARM1	B6A8C7	271 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813		F8W8V4	182 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ADAM10	O14672	748 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	EREG	O14944	169 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SLC4A1	P02730	911 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	HLA-DQB2	P05538	268 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	POLB	P06746	335 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TPO	P07202	933 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MYBL1	P10243	752 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	COX6A1	P12074	109 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	GZMA	P12544	262 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PVR	P15151	417 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FER	P16591	822 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF24	P17028	368 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	OGDH	Q02218	1023 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PDK2	Q15119	407 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MUM1	Q2TAK8	710 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ARSK	Q6UWY0	536 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	BEND4	Q6ZU67	534 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	DAAM2	Q86T65	1068 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF398	Q8TD17	642 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FAM222B	Q8WU58	562 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	HSPH1	Q92598	858 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF653	Q96CK0	615 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
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CEP170-216	ENST00000490813	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	THAP2	Q9H0W7	228 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	GAN	Q9H2C0	597 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MPDZ	O75970	2070 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
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CEP170-216	ENST00000490813	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	C2orf81	A6NN90	581 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	RNF212B	A8MTL3	300 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	UGT1A9	O60656	530 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	AP2A1	O95782	977 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	RPN2	P04844	631 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	HEXB	P07686	556 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SP1	P08047	785 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MMP2	P08253	660 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	BMP7	P18075	431 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	UGT1A6	P19224	532 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	KIR2DL3	P43628	341 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PRLHR	P49683	370 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TAS2R50	P59544	299 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	IHH	Q14623	411 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CAMK4	Q16566	473 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TAZ	Q16635	292 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ACER2	Q5QJU3	275 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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