RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CATSPERZQ9NTU4 200 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 M0R082 166 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 INPPL1O15357 1258 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PCDHGA12O60330 932 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN3O60637 253 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RPP40O75818 363 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 IGLV3-27P01718 113 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CNPP09543 421 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CYP2A7P20853 494 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 UGT2B10P36537 528 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR3A3P47888 321 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RAD51Q06609 339 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 XKR7Q5GH72 579 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TJAP1Q5JTD0 557 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FAM26DQ5JW98 314 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SYCE2Q6PIF2 218 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GALNT10Q86SR1 603 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MDGA1Q8NFP4 955 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RHEBL1Q8TAI7 183 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PYURFQ96I23 114 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 NPAP1Q9NZP6 1156 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FNIP2Q9P278 1114 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SLC10A3P09131 477 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DDOSTP39656 456 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 IL12RB1P42701 662 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ACVR1Q04771 509 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PARP15Q460N3 678 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SDE2Q6IQ49 451 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR4K2Q8NGD2 314 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1191Q96A73 305 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 VPS35Q96QK1 796 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TIGARQ9NQ88 270 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ABCG2Q9UNQ0 655 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ASB1Q9Y576 335 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TET1Q8NFU7 2136 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MICAL3Q7RTP6 2002 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PER2O15055 1255 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ADAM12O43184 909 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF9O43307 516 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR1I1O60431 355 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GJB5O95377 273 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SERPINF2P08697 491 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RPL17P18621 184 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 HNF4AP41235 474 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 STC1P52823 247 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ACLYP53396 1101 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FCHO2Q0JRZ9 810 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ARMCX4Q5H9R4 360 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PRR23CQ6ZRP0 262 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 BHMTQ93088 406 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TMCO6Q96DC7 493 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CCDC115Q96NT0 180 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ACTL8Q9H568 366 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SYTL2Q9HCH5 934 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 BPIFA1Q9NP55 256 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RNF186Q9NXI6 227 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 H3BQ06 376 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CSF2P04141 144 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 UBL4AP11441 157 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ATF6P18850 670 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 IDH2P48735 452 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ELP6Q0PNE2 266 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GALNT7Q86SF2 657 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD46Q86W74 232 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 STX19Q8N4C7 294 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 BRSK1Q8TDC3 778 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FBLIM1Q8WUP2 373 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GTF2H4Q92759 462 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FATE1Q969F0 183 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RMDN1Q96DB5 314 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TRIB3Q96RU7 358 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DPY30Q9C005 99 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RUBCNLQ9H714 662 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MARCH5Q9NX47 278 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R13Q9NYV9 303 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PCTPQ9UKL6 214 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D24Q9ULP9 559 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ARNTLO00327 626 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TMCC2O75069 709 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.5 ms