RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX9Q9Y5X1 595 aa5.67□□□□□ -1.5
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RABGGTB-209ENST00000473406 DENND3A2RUS2 1198 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-209ENST00000473406 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.51e-6■■■□□ 15.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 FAM20AQ96MK3 541 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-209ENST00000473406 ACTL8Q9H568 366 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-209ENST00000473406 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf105B2RV13 164 aa5.64□□□□□ -1.51
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RABGGTB-209ENST00000473406 IKBKBO14920 756 aa5.64□□□□□ -1.51
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RABGGTB-209ENST00000473406 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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RABGGTB-209ENST00000473406 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NSFP46459 744 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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