RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472161.1

RPS3AP49-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 49, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP49, Length 790 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP49-201ENST00000472161 PTK6Q13882 451 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ERV3-1Q14264 604 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 KRT33BQ14525 404 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 KIR2DS3Q14952 304 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 POU4F3Q15319 338 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 LCE3BQ5TA77 95 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CNSTQ6PJW8 725 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 COX15Q7KZN9 410 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZNF605Q86T29 641 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CREG2Q8IUH2 290 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 SULF2Q8IWU5 870 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 OR8K5Q8NH50 307 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 PWWP2AQ96N64 755 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 GBP5Q96PP8 586 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 EPN3Q9H201 632 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 BFARQ9NZS9 450 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 STOML1Q9UBI4 398 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 POLG2Q9UHN1 485 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 PADI1Q9ULC6 663 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 MYO1CO00159 1063 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 MASP2O00187 686 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 SLC28A2O43868 658 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ADAM11O75078 769 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 KATNA1O75449 491 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 NDUFS3O75489 264 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ESR1P03372 595 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 MT-ND3P03897 115 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 APOA4P06727 396 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 UMODP07911 640 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CELA3AP09093 270 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CYP2A7P20853 494 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 MCM3P25205 808 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ATP5DP30049 168 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CCR10P46092 362 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 EFNA3P52797 238 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ITGA1P56199 1179 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CUL1Q13616 776 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CRYMQ14894 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 NCF4Q15080 339 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ARMC3Q5W041 872 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 NEPROQ6NW34 567 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 LRRC6Q86X45 466 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 RELL1Q8IUW5 271 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 SHISA5Q8N114 240 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZBTB2Q8N680 514 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 OR2L3Q8NG85 312 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CD200R1Q8TD46 325 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 DLG3Q92796 817 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 TCTN2Q96GX1 697 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 CATSPER2Q96P56 530 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP49-201ENST00000472161 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms