RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 MPP5Q8N3R9 675 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 PRR18Q8N4B5 295 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2C3Q8N628 320 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 HPS1Q92902 700 aa7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 VOPP1Q96AW1 172 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 DPH1Q9BZG8 443 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 MARCH7Q9H992 704 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 RAB21Q9UL25 225 aa7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 LRP4O75096 1905 aa7.12□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A087WV62 115 aa7.12□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.12□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 EFSO43281 561 aa7.12□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 ERCC2P18074 760 aa7.12□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CNTFP26441 200 aa7.12□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 OMDQ99983 421 aa7.12□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.12□□□□□ -1.27
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RPUSD3-212ENST00000466141 PDFQ9HBH1 243 aa7.12□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 THSD1Q9NS62 852 aa7.12□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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