RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 CDC14CA4D256 554 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 PIAS1O75925 651 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 SFTPCP11686 197 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 HRH2P25021 359 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 PGGT1BP53609 377 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NAB1Q13506 487 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 LY6DQ14210 128 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NCF4Q15080 339 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 PHKG1Q16816 387 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00303Q3SY05 128 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf189Q5VU69 101 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ADCK2Q7Z695 626 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 PAQR7Q86WK9 346 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 PPM1NQ8N819 430 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FBF1Q8TES7 1133 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ATL1Q8WXF7 558 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 MED8Q96G25 268 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 GBP5Q96PP8 586 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 RUFY1Q96T51 708 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 MED13Q9UHV7 2174 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 SPTA1P02549 2419 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1B0GX78 115 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 DSCR3O14972 297 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 CTSBP07858 339 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ALAS2P22557 587 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 PHBP35232 272 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 RELAQ04206 551 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NAE1Q13564 534 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF460Q14592 562 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 UGT8Q16880 541 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 GRTP1Q5TC63 336 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF425Q6IV72 752 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 LCN10Q6JVE6 187 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 IFT81Q8WYA0 676 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FMO2Q99518 471 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR22Q99680 433 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 CUTCQ9NTM9 273 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 TCFL5Q9UL49 500 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 HYKKA2RU49 373 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FITM1A5D6W6 292 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NRP2O60462 931 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 GUCA1CO95843 209 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 CAPN1P07384 714 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM87AP0C7U9 286 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 STMN1P16949 149 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 MLIPQ5VWP3 458 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 LCTLQ6UWM7 567 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 SBSNQ6UWP8 590 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 C17orf64Q86WR6 236 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP97Q8IW35 865 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 THAP4Q8WY91 577 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXL8Q96CD0 374 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 HAUS8Q9BT25 410 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 SGPP1Q9BX95 441 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP1-205ENST00000466097 STARD5Q9NSY2 213 aa14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms