RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 SFTPCP11686 197 aa22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP5-208ENST00000459627 CCL11P51671 97 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5-208ENST00000459627 PMS2P54278 862 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5-208ENST00000459627 PLTPP55058 493 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5-208ENST00000459627 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP1A4Q13733 1029 aa22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP5-208ENST00000459627 FAM45AQ8TCE6 357 aa22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP5-208ENST00000459627 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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SH3BP5-208ENST00000459627 ACSS2Q9NR19 701 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-208ENST00000459627 CTSFQ9UBX1 484 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-208ENST00000459627 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-208ENST00000459627 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-208ENST00000459627 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-208ENST00000459627 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-208ENST00000459627 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-208ENST00000459627 CDC7O00311 574 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC16A5O15375 505 aa22.81■■□□□ 1.24
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