RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 KPNA5O15131 536 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 P2RX6O15547 441 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXS1O43638 330 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFS3O75489 264 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDAH2O95865 285 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALPPP05187 535 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CELA2AP08217 269 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX6A1P12074 109 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXCR5P32302 372 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX11P35716 441 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCNFP41002 786 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEA3P43357 314 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLCN7P51798 805 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCZ1BP86790 482 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 HKDC1Q2TB90 917 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR9A1PQ8NGU1 263 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF480Q8WV37 535 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf44Q96CB5 159 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2A5Q96R48 311 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKP4Q99569 1192 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 BFARQ9NZS9 450 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP10Q9P2G4 905 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBN2P35556 2912 aa8.05□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 E7ENX8 843 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPP00738 406 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESR1P03372 595 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCTP40126 519 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLRBP48167 497 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS41P49754 854 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TDGF1P3P51864 188 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TERF1P54274 439 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDK16Q00536 496 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAP2Q03519 686 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBBP7Q16576 425 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYT16Q17RD7 645 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ICE2Q659A1 982 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4orf22Q6V702 233 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRHL3Q8TE85 626 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAAR6Q96RI8 345 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCF12Q99081 682 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRB3Q9BUF7 120 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 LHPPQ9H008 270 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 LZTFL1Q9NQ48 299 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAC3Q9UHF0 121 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.04□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 IDSB3KWA1 339 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GFYI3L273 518 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP104O60308 925 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLHL41O60662 606 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP1O94782 785 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC16A8O95907 504 aa8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms