RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LBPP18428 481 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLDN15P56746 228 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HTD2P86397 168 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MFAP5Q13361 173 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC39A14Q15043 492 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDK1Q15118 436 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR141Q7Z602 305 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC110Q8TBZ0 833 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NEUROG1Q92886 237 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BICD1Q96G01 975 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNK16Q96T55 309 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CSF3RQ99062 836 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSPYL1Q9H0U9 437 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBQLN3Q9H347 655 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACTL8Q9H568 366 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAGEF1Q9HAY2 307 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POLE3Q9NRF9 147 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR173Q9NS66 373 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TAS2R3Q9NYW6 316 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FETUBQ9UGM5 382 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL16Q14005 1332 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PPK0 400 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 O00370 1275 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF197O14709 1029 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARPC2O15144 300 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCO2O43819 266 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRAF2O60831 178 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRIM16O95361 564 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ABHD2P08910 425 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC00271P0C7V0 271 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STAG3L1P0CL83 205 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRT3P12035 628 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CPA3P15088 417 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPC3P51654 580 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UCP2P55851 309 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GSDMDP57764 484 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GAGE5Q13069 117 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GAGE6Q13070 117 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TAF13Q15543 124 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTPN14Q15678 1187 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACKR1Q16570 336 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CA9Q16790 459 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FUT10Q6P4F1 479 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PODNL1Q6PEZ8 512 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KDM8Q8N371 416 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PGBD5Q8N414 524 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SFRP1Q8N474 314 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BMPERQ8N8U9 685 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NEK11Q8NG66 645 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 URGCPQ8TCY9 931 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ELP5Q8TE02 316 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IRGQQ8WZA9 623 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ABCG4Q9H172 646 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM245Q9H330 911 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CUEDC2Q9H467 287 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q9H8V8 135 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 F8VVB4 439 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 F8VWA3 439 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KDM4BO94953 1096 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 REC8O95072 547 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCNA2P20248 432 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AHCYP23526 432 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VAMP7P51809 220 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GMFBP60983 142 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LCP2Q13094 533 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms