RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 LIX1LQ8IVB5 337 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL4Q8N3J2 472 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NELL2Q99435 816 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SP140LQ9H930 580 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLAMF7Q9NQ25 335 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf18Q9UK00 162 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2G10O15496 165 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR47O94967 919 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL10O95999 233 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBC1P01850 177 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMP1P11279 417 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COL6A1P12109 1028 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP3CCP48454 512 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3CGP48736 1102 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLAURQ03405 335 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF385BQ569K4 471 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM2Q99965 735 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf78A6NCI8 922 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC154A6NI56 674 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC24AO95486 1093 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF682O95780 498 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ANGPTL1O95841 491 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TTPAP49638 278 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT2B15P54855 530 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PFN3P60673 137 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VBP1P61758 197 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBP1BP68106 108 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP1A4Q13733 1029 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NPTX1Q15818 432 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRF1Q5T601 910 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP2U1Q7Z449 544 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SVOPQ8N4V2 548 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AADATQ8N5Z0 425 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GGHQ92820 318 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC12A9Q9BXP2 914 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CD244Q9BZW8 370 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT3Q9UH03 358 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OARD1Q9Y530 152 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM43BA6NCK2 446 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC730098B7Z3J9 87 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 G3V3Q6 166 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CTDSP2O14595 271 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ADORA3P0DMS8 318 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AMD1P17707 334 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH4A1P30038 563 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX11P35716 441 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK1DP48730 415 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA7P48741 367 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPC1P48995 793 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAN2A2P49641 1150 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS6P49758 472 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AGAP6Q5VW22 663 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMCX6Q7L4S7 300 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AGAP4Q96P64 663 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5M11Q96RB7 305 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ15Q99712 375 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GKN1Q9NS71 199 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ACER3Q9NUN7 267 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COL4A2P08572 1712 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JMP0 313 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SYN3O14994 580 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TPST2O60704 377 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX2O60749 519 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LILRB5O75023 590 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A1P02730 911 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GAAP10253 952 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ESRRGP62508 458 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RPP38P78345 283 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM132AQ24JP5 1023 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP7D1Q3KQU3 841 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST9Q7L1S5 443 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 APIPQ96GX9 242 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.51□□□□□ -1.85
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