RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 POU6F1Q14863 301 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 IQCB1Q15051 598 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ACER2Q5QJU3 275 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SPINK14Q6IE38 97 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FGD2Q7Z6J4 655 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM200AQ86VY9 491 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 OR2L3Q8NG85 312 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF354BQ96LW1 612 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 HEMGNQ9BXL5 484 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 TGIF2Q9GZN2 237 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CXXC4Q9H2H0 198 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SYNPO2LQ9H987 977 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MKL2Q9ULH7 1088 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SCN2AQ99250 2005 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 H0YGG7 62 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN12O95859 305 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 RPN2P04844 631 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ERVK-10P10266 1014 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 DRD2P14416 443 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 OR1C1Q15619 314 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CCSMST1Q4G0I0 132 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 H3F3CQ6NXT2 135 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 BBS12Q6ZW61 710 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 GHDCQ8N2G8 530 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 OR2A1Q8NGT9 310 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 NPAS2Q99743 824 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FBN3Q75N90 2809 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC162PA2VCL2 907 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 IQCF5A8MTL0 148 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 PRRG2O14669 202 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 PSTPIP1O43586 416 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FOXS1O43638 330 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 APOC2P02655 101 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 C8orf89P0DMQ9 161 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MARCKSL1P49006 195 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 UBASH3AP57075 661 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 HKDC1Q2TB90 917 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 BTBD16Q32M84 506 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 LANCL3Q6ZV70 420 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 IQCDQ96DY2 449 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MVB12AQ96EY5 273 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FOXC2Q99958 501 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF559Q9BR84 538 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 UCK2Q9BZX2 261 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 GOLPH3Q9H4A6 298 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPV9 198 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 OR2A25A4D2G3 310 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FOXO6A8MYZ6 492 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 AKR1B10O60218 316 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MAN1A2O60476 641 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CD46P15529 392 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 PSMA3P25788 255 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 EMP3P54852 163 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 TFF3Q07654 80 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 RNFT1Q5M7Z0 435 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD11Q693B1 232 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC8BQ6P9F7 803 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 KATNAL2Q8IYT4 538 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 RCOR2Q8IZ40 523 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SHISA5Q8N114 240 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ACTL9Q8TC94 416 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 RAD51AP1Q96B01 352 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA13Q96N96 652 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FAM118BQ9BPY3 351 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 KCNK13Q9HB14 408 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 HRH3Q9Y5N1 445 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ALG6Q9Y672 507 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 NFS1Q9Y697 457 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0U1RQJ8 604 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 I3L1I5 382 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SP1P08047 785 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA5P08758 320 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 BDKRB1P46663 353 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2R2AP63151 447 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 PLAG1Q6DJT9 500 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms