RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397912.3

PRKRIP1-201, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKRIP1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-201ENST00000397912 ASB11Q8WXH4 323 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 FRG2BQ96QU4 278 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 PANX1Q96RD7 426 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 COPS8Q99627 209 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 KRT84Q9NSB2 600 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 AASSQ9UDR5 926 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PRKRIP1-201ENST00000397912 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 CLDN24A6NM45 220 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 FPGTO14772 594 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 CA12O43570 354 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 GREM1O60565 184 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SCN2BO60939 215 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 EPN2O95208 641 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 GKP32189 559 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ITGA1P56199 1179 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 PLD1Q13393 1074 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 VEZF1Q14119 521 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 DGCR6Q14129 220 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 NEK5Q6P3R8 708 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 PTOV1Q86YD1 416 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 APCDD1Q8J025 514 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 LGALS12Q96DT0 336 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 BTBD2Q9BX70 525 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 REEP1Q9H902 201 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 BRCA2P51587 3418 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 NUAK1O60285 661 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 FAM20BO75063 409 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 FKBP9O95302 570 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 EFEMP2O95967 443 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SLC10A3P09131 477 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 OR56A5P0C7T3 313 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SELPP16109 830 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 KRT20P35900 424 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 HALP42357 657 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 WNT3P56703 355 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 NCS1P62166 190 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 B4GALNT1Q00973 533 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF33BQ06732 778 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 OR2A25A4D2G3 310 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 TTC34A8MYJ7 566 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SLC16A5O15375 505 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 NBNO60934 754 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ABLIM3O94929 683 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 DIRAS1O95057 198 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 IGSF6O95976 241 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 EPHA2P29317 976 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SERPINA4P29622 427 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ALDH4A1P30038 563 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 C21orf58P58505 322 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SREBF2Q12772 1141 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 NPRL3Q12980 569 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SP140Q13342 867 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 UGT8Q16880 541 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 A8MX80 341 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms