RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380568.7

GCOM1-201, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene GCOM1, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-201ENST00000380568 ASMTP46597 345 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ACSM2AQ08AH3 577 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 NFYCQ13952 458 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 KRT33BQ14525 404 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ACSM2BQ68CK6 577 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 HPS6Q86YV9 775 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 LRRC58Q96CX6 371 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 AIF1LQ9BQI0 150 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 MENTQ9BUN1 341 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ACTL8Q9H568 366 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ADA2Q9NZK5 511 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CA14Q9ULX7 337 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 KCNK6Q9Y257 313 aa18.5■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 PIPSLA2A3N6 862 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 KRT87PA6NCN2 255 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 PDE5AO76074 875 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 IL9P15248 144 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 PRPS1L1P21108 318 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 HRH2P25021 359 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 PKLRP30613 574 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 NME5P56597 212 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ABATP80404 500 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 BNIP2Q12982 314 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TLR1Q15399 786 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 RETREG3Q86VR2 466 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ZFPM2Q8WW38 1151 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CAMK1GQ96NX5 476 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 MAP10Q9P2G4 905 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 IGHV4-34P06331 123 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 HSD17B1P14061 328 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CD1EP15812 388 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 RPL10P27635 214 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 GCKP35557 465 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 NEK2P51955 445 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 FLOT2Q14254 428 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 ANO7Q6IWH7 933 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 GALNT18Q6P9A2 607 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TTLQ8NG68 377 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 OR1E3Q8WZA6 343 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 SH3KBP1Q96B97 665 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TEX37Q96LM6 180 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 GUCD1Q96NT3 240 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 MYOCQ99972 504 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TRIM15Q9C019 465 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 RMND5AQ9H871 391 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa18.49■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 MYO10Q9HD67 2058 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 PCNAP12004 261 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 IL12AP29459 219 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 SHMT2P34897 504 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 RPL3P39023 403 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CCR8P51685 355 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CLDN2P57739 230 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 SRP54P61011 504 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 LRRC74AQ0VAA2 488 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CEACAM7Q14002 265 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 RCN1Q15293 331 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 RPE65Q16518 533 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 FAM129CQ86XR2 697 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CAMKK1Q8N5S9 505 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CXorf40BQ96DE9 158 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 SH3GL1Q99961 368 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 GPR27Q9NS67 375 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CD300AQ9UGN4 299 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 CYP8B1Q9UNU6 501 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 L3MBTL1Q9Y468 752 aa18.48■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 A0A1W2PPC4 97 aa18.47■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 FXYD1O00168 92 aa18.47■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 SEMA3DO95025 777 aa18.47■□□□□ 0.55
GCOM1-201ENST00000380568 KCNH1O95259 989 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms