RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378156.8

NPHP4-201, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP4, Length 4,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-201ENST00000378156 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ADAMDEC1O15204 470 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MAFKO60675 156 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CLCNKAP51800 687 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 KCNJ9Q92806 393 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 A0A1W2PP18 115 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ALDH4A1P30038 563 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 IL18Q14116 193 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 DAG1Q14118 895 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 LRRC32Q14392 662 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PJA1Q8NG27 643 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF563Q8TA94 476 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MAPK15Q8TD08 544 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MTRRQ9UBK8 725 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SOCS5O75159 536 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 AGTR2P50052 363 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PTPN5P54829 565 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 Q6ZVL8 140 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 STX12Q86Y82 276 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TPK1Q9H3S4 243 aa14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SLC30A4O14863 429 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ORC5O43913 435 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 NDUFS1P28331 727 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CCR8P51685 355 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SLC38A4Q969I6 547 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 KCNK13Q9HB14 408 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CALML5Q9NZT1 146 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 OR5F1O95221 314 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CLIC3O95833 236 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TGFB1P01137 390 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 RHOP08100 348 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 GKP32189 559 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TPTEP56180 551 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 DCST1Q5T197 706 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TTLQ8NG68 377 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 DSN1Q9H410 356 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF879B4DU55 563 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 IFNGP01579 166 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 G6PDP11413 515 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CDH1P12830 882 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CPN2P22792 545 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 OGFOD2Q6N063 350 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TRNP1Q6NT89 227 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PDPK1O15530 556 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PRKD3O94806 890 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 AP3S2P59780 193 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SMCO1Q147U7 214 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 RTL4Q6ZR62 310 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 BEND5Q7L4P6 421 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 NXPE1Q8N323 547 aa14.63□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms