RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369301.3

NHLRC2-201, Transcript of NHL repeat containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene NHLRC2, Length 11,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF33AQ06730 810 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 LCTLQ6UWM7 567 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 IQCHQ86VS3 1027 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 GINS3Q9BRX5 216 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 Q9N2J8 555 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 PP2D1A8MPX8 630 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TGM5O43548 720 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 CLEC3BP05452 202 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 AQP1P29972 269 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 CAMLGP49069 296 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ALG2Q9H553 416 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 A0A1W2PPL8 197 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 DPP6P42658 865 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 NUDT6P53370 316 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 GBA3Q9H227 469 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 GIN1Q9NXP7 522 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 RNF13O43567 381 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 SERPINA6P08185 405 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 CTBP1Q13363 440 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 MAB21L1Q13394 359 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 KIF25Q9UIL4 384 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 I3L521 148 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 SCELO95171 688 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.075e-6■□□□□ 9
NHLRC2-201ENST00000369301 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 GNG8Q9UK08 70 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 A0A087WWV3 80 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TPPPO94811 219 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TGDSO95455 350 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 AMY2BP19961 511 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 KITLGP21583 273 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 HTR3AP46098 478 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 SLC20A2Q08357 652 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 IRF5Q13568 498 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TRIB1Q96RU8 372 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 RHOP08100 348 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 FXYD6P3P58550 94 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 PHC1P78364 1004 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 NUDT7P0C024 238 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 DDCP20711 480 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 CX3CR1P49238 355 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 GRHL3Q8TE85 626 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 FAM151AQ8WW52 585 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 OSER1Q9NX31 292 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TSPOAP1O95153 1857 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TAS2R20P59543 309 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.39□□□□□ -1.07
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF681Q96N22 645 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms