RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MARVELD2Q8N4S9 558 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA5Q8NB90 893 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 CAPZA3Q96KX2 299 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 EURLQ9NYK6 297 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 EHD2Q9NZN4 543 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 PRELID1Q9Y255 219 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CHKBQ9Y259 395 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 PALLDQ8WX93 1383 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 DCCP43146 1447 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 A0A0G2JLW4 131 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 A8MXQ7 604 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CENPBD1B2RD01 187 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC188H7C350 402 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEB3O15480 346 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 SCO2O43819 266 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 PDE5AO76074 875 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 RUNX2Q13950 521 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 DPYSQ14117 519 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 TRADDQ15628 312 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 MAGEB18Q96M61 343 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 TCEANC2Q96MN5 208 aa3.45□□□□□ -1.86
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