RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 GALNT7Q86SF2 657 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 MRGPREQ86SM8 312 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 PALM2Q8IXS6 379 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 IFT20Q8IY31 132 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 SMPDL3AQ92484 453 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 CDKL2Q92772 493 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 INPP5DQ92835 1189 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 CERS2Q96G23 380 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP36Q96G28 342 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 PKP4Q99569 1192 aa7.34□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 ING2Q9H160 280 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 DPH5Q9H2P9 285 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.34□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 CUTCQ9NTM9 273 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS7Q9Y394 339 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0J9YVX5 310 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 OR2A25A4D2G3 310 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FITM1A5D6W6 292 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 GFYI3L273 518 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 CCNDBP1O95273 360 aa7.33□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 CSRP3P50461 194 aa7.33□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 STEAP4Q687X5 459 aa7.33□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.33□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF480Q8WV37 535 aa7.33□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 DPH7Q9BTV6 452 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CLMPQ9H6B4 373 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 WDR54Q9H977 334 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.33□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 ZFATQ9P243 1243 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TAC3Q9UHF0 121 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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