RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361371.9

LTN1-201, Transcript of listerin E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTN1, Length 7,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1-201ENST00000361371 FAM86B1Q8N7N1 296 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 OR10G6Q8NH81 332 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 HUS1BQ8NHY5 278 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 WDR20Q8TBZ3 569 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PYDC1Q8WXC3 89 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 RAD51AP1Q96B01 352 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 WDR92Q96MX6 357 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 NTMT1Q9BV86 223 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 SLAMF7Q9NQ25 335 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 GPR34Q9UPC5 381 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 V9GYQ6 96 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PLXNA3P51805 1871 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 FAM149AA5PLN7 773 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 HRO43593 1189 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CTSVO60911 334 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 EBLN1P0CF75 366 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 MTPNP58546 118 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PSME3P61289 254 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 RAE1P78406 368 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 DUSP2Q05923 314 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 KRT72Q14CN4 511 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ZIC1Q15915 447 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 UGT8Q16880 541 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 LRRC36Q1X8D7 754 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 UAP1L1Q3KQV9 507 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 NUDT18Q6ZVK8 323 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 UBE3DQ7Z6J8 389 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 GALNT13Q8IUC8 556 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PHACTR4Q8IZ21 702 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 LILRA2Q8N149 483 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 OR9A1PQ8NGU1 263 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CCDC126Q96EE4 140 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 NELL2Q99435 816 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CHRDQ9H2X0 955 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 DPEP2Q9H4A9 486 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ELOVL6Q9H5J4 265 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 FAM60AQ9NP50 221 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 LHX9Q9NQ69 397 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 STARD5Q9NSY2 213 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 WNT16Q9UBV4 365 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 POMPQ9Y244 141 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 NUMA1Q14980 2115 aa2.76□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 TMEM265A0A087WTH1 108 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ZNF860A6NHJ4 632 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ACOT8O14734 319 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 KMOO15229 486 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CLDN9O95484 217 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 UROSP10746 265 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 IDSP22304 550 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CALB2P22676 271 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PLA2G16P53816 162 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CLDN6P56747 220 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 STARD6P59095 220 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CYP4F3Q08477 520 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 NKG7Q16617 165 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 FRG2Q64ET8 278 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 OGFOD2Q6N063 350 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 USP30Q70CQ3 517 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 VN1R4Q7Z5H5 301 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 HMGN2P46Q86SG4 172 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 DSELQ8IZU8 1212 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 OR4N4Q8N0Y3 316 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 TCEAL3Q969E4 200 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 FRG2BQ96QU4 278 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 OR2M4Q96R27 311 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 DPH7Q9BTV6 452 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 WDR41Q9HAD4 459 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 SLC6A20Q9NP91 592 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 KLHL3Q9UH77 587 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ACSL6Q9UKU0 697 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ISM1B1AKI9 464 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 VEGFDO43915 354 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 TPST1O60507 370 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 ATP6V1G2O95670 118 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 SERPIND1P05546 499 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 C8GP07360 202 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa2.75□□□□□ -1.97
LTN1-201ENST00000361371 PCNAP12004 261 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms