RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 IRF1P10914 325 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CD247P20963 164 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 OR1E1P30953 314 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM17P78536 824 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 SGCGQ13326 291 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TUSC3Q13454 348 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 FITM2Q8N6M3 262 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 BBS10Q8TAM1 723 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RAB12Q6IQ22 244 aa4.79□□□□□ -1.64
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