RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339950.4

USP1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP1, Length 3,996 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1-201ENST00000339950 ZNF385DQ9H6B1 395 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 USE1Q9NZ43 259 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 PCP4L1A6NKN8 68 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CA12O43570 354 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 HSD17B1P14061 328 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ZNF33AQ06730 810 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 RRM2BQ7LG56 351 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 P2RY8Q86VZ1 359 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TMEM25Q86YD3 366 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 FAR1Q8WVX9 515 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ZNF583Q96ND8 569 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ZNF382Q96SR6 550 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 APOL4Q9BPW4 351 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 DYRK4Q9NR20 520 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 MTRRQ9UBK8 725 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 FZD4Q9ULV1 537 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 KRBA1A5PL33 1030 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 IDH3BO43837 385 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 MAGEA8P43361 318 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TUBA4AP68366 448 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ZNF605Q86T29 641 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 FLCNQ8NFG4 579 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 AP2M1Q96CW1 435 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ZNF558Q96NG5 402 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 MGME1Q9BQP7 344 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 OR2AG1Q9H205 316 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 RHBGQ9H310 441 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 EHD3Q9NZN3 535 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TET1Q8NFU7 2136 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 FAM227AF5H4B4 570 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TNFRSF21O75509 655 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 IGLV3-25P01717 112 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 FABP3P05413 133 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CKMT1AP12532 417 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 MYF6P23409 242 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 SLC36A3Q495N2 470 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ACPTQ9BZG2 426 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 NUAK2Q9H093 628 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa11.6□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 DOCK1Q14185 1865 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TNFRSF11BO00300 401 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 RGS10O43665 173 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 OR10H3O60404 316 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 BMP10O95393 424 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ELFN1P0C7U0 828 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 DCTP40126 519 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 FRG2Q64ET8 278 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CEP68Q76N32 757 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 SLC34A3Q8N130 599 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 NXPE1Q8N323 547 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 C10orf111Q8N326 155 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ZFP90Q8TF47 636 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 FRG2BQ96QU4 278 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 NRTNQ99748 197 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 COPS4Q9BT78 406 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 PSME2Q9UL46 239 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 TSPAN6O43657 245 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 EPOP01588 193 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CATP04040 527 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 C8AP07357 584 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 FGF4P08620 206 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ETFAP13804 333 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 CCR7P32248 378 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 MLLT10P55197 1068 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 DGUOKQ16854 277 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ZNF461Q8TAF7 563 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 GTF2H4Q92759 462 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 EID2BQ96D98 161 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 PHOX2BQ99453 314 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ARMC1Q9NVT9 282 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 SPTBP11277 2137 aa11.59□□□□□ -0.55
USP1-201ENST00000339950 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms