RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.15■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.15■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 POLEQ07864 2286 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 A0A0J9YVX5 310 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CTAGE9A4FU28 777 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CMPK1P30085 196 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 SLC35F6Q8N357 371 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 OR11G2Q8NGC1 345 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 GRHL3Q8TE85 626 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 VPS50Q96JG6 964 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.14■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 HYKKA2RU49 373 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ENO4A6NNW6 628 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 MYO1CO00159 1063 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 E2F3O00716 465 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 NRP2O60462 931 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 USP1O94782 785 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ERGP11308 486 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CLCN7P51798 805 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 YBX1P67809 324 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CDC16Q13042 620 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 NAA25Q14CX7 972 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 RNF44Q7L0R7 432 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 DPH7Q9BTV6 452 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.13■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CACNA1DQ01668 2161 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 OR2A25A4D2G3 310 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CATP04040 527 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 Q0VFX4 171 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CTBP1Q13363 440 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 TLR1Q15399 786 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 TTLL9Q3SXZ7 439 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 FAR1Q8WVX9 515 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 SMPDL3AQ92484 453 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 SLC30A3Q99726 388 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CRB3Q9BUF7 120 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 OSGIN2Q9Y236 505 aa20.12■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 LRRTM2O43300 516 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 KIF5CO60282 957 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 MED26O95402 600 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 EDN3P14138 238 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 HSD17B2P37059 387 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEA3P43357 314 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 LINC00696Q6ZRV3 163 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 PKP4Q99569 1192 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF304Q9HCX3 659 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.11■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 PHF2O75151 1096 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 HPP00738 406 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 ACPPP15309 386 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 PNLIPRP1P54315 467 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 PER3P56645 1201 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 OCA2Q04671 838 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 KLC1Q07866 573 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 MFAP5Q13361 173 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 LONRF1Q17RB8 773 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.1■□□□□ 0.81
SOCS1-201ENST00000332029 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms