RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312295.4

RTP1-201, Transcript of receptor transporter protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RTP1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1-201ENST00000312295 PIPSLA2A3N6 862 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RPN2P04844 631 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 IDSP22304 550 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 HTR1BP28222 390 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ACTR1BP42025 376 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ACTR1AP61163 376 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ZP2Q05996 745 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 KIAA0040Q15053 153 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PIGGQ5H8A4 983 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 FXYD1O00168 92 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 UGDHO60701 494 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ACTR3P61158 418 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CYP4F2P78329 520 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 NFYCQ13952 458 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CCNIQ14094 377 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 LRRC32Q14392 662 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ALG11Q2TAA5 492 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RMI1Q9H9A7 625 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CROTQ9UKG9 612 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.61□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 A0A1W2PP18 115 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 FAM234BA2RU67 622 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PSMG1O95456 288 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 GBAP04062 536 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SDC1P18827 310 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CD6P30203 668 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 HNF4AP41235 474 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RPE65Q16518 533 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLC6A18Q96N87 628 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 DPY30Q9C005 99 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 FEZF1A0PJY2 475 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PRR19A6NJB7 356 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 H0YIV9 168 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 AKAP10O43572 662 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 STATHP02808 62 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 AMD1P17707 334 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MS4A2Q01362 244 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PRKCQQ04759 706 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MED27Q6P2C8 311 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PLD3Q8IV08 490 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ASB12Q8WXK4 309 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 NDE1Q9NXR1 346 aa14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 A0A1W2PPV9 198 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MAP3K7O43318 606 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TGFB1P01137 390 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 JAK1P23458 1154 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RABL3Q5HYI8 236 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ATG9BQ674R7 924 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ADCK2Q7Z695 626 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PATE1Q8WXA2 126 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TMEM74Q96NL1 305 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SERPINI1Q99574 410 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 OR51B5Q9H339 312 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PIF1Q9H611 641 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.59□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 KLF15Q9UIH9 416 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms